西双版纳植物园为热带树种建DNA条形码数据库

16.07.2015  15:07

新华网昆明7月15日电(记者岳冉冉)记者从中科院昆明分院获悉,西双版纳植物园建立了我国首个热带森林树种DNA条形码数据库,能够利用植物的一小段DNA序列快速进行物种鉴定,目前已收录了655个热带树种的DNA条形码数据,为生物多样性保护提供了一个有效的可靠途径。

据西双版纳植物园植物系统发育与保护生物学研究组成员慈秀芹介绍,在李捷研究员的带领下,从2008年起,研究组对西双版纳国家级自然保护区的热带植物进行了采样,对不同植被类型的热带森林开展了区域DNA条形码研究,从隶属于76科、259属、655树种的2052个个体中获得了rbcL、matK、trnH-psbA、ITS四个DNA条形码片段的5583条序列。科学家利用序列比对的方法,结合传统形态学观察及专家鉴定,发现并纠正了野外鉴定错误的99个个体。此外,研究发现作为国际植物DNA条形码联盟推荐的标准条形码rbcL和matK对西双版纳热带森林乔木树种的鉴别能力有限,又将ITS和trnH-psbA联合共同列为西双版纳地区热带森林树种的DNA条形码。

慈秀芹说:“现在西双版纳热带树木的DNA条形码数据还在增加中,与其他热带地区相比,西双版纳地区树种丰富,四种条码鉴别法已不能满足其鉴定需要,未来可能需要进一步引入新的条码。

据介绍,热带森林树种的DNA条形码数据库为生物多样性的大尺度调查提供了有力的工具,促进了系统发育群落生态学等相关学科的快速发展;同时,为进一步对该地区开展系统发育多样性的评估和自然保护区合理有效的规划,以及珍稀濒危物种的保护提供了可能,为群落系统发育进化树的构建和外来入侵种的快速鉴定提供了重要的基础数据。