2016年5月25日至5月28日，省粮食局、省发改委、省财政厅、农发行云南省分行、中储粮云南省分公司五家单位组成2016年省级粮食库存联合抽查组四个组，分别对昆明市粮食局、玉溪市粮食局、楚雄州粮食局、迪庆州粮食局、云南省储备粮管理公司、云南军粮集团有限公司进行了粮食库存省级抽查。
抽查组遵循“双随机”检查及重点抽查相结合的原则，采取核对账目和清查实物相结合的方法进行认真清查，对承储企业存储的中央储备粮、国家临时存储粮、地方储备粮等政策性粮食及国有商品粮的数量、质量、储备粮轮换、政策性粮食补贴资金拨付、仓储管理和国家粮食购销政策的执行情况进行了全面检查，抽查率达库存检查范围粮食总量的25%以上，合格率为100%。
通过检查，省级四个抽查组认为抽查的四个州市及局直属两家企业粮食库存数量真实、质量良好、管理规范、账账相符、账实相符。